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Adaptive Biotech: 用基因測序解碼自適應(yīng)免疫系統(tǒng),受微軟、羅氏青睞

說起一滴血檢測癌癥,很多人可能都會因為Theranos的驚天騙局而對此嗤之以鼻。雖然Theranos的90億估值泡沫破滅,但是一滴血測量疾病這項技術(shù)本身的價值不能被磨滅。

在硅谷,還有一家持續(xù)看好滴血測癌癥的公司:Adaptive Biotechnologies。不同于Theranos高調(diào)張揚的作風,Adaptive Biotechnologies更加務(wù)實低調(diào)。根據(jù)斯坦福大學的一篇統(tǒng)計調(diào)查顯示,在醫(yī)療領(lǐng)域的諸多獨角獸發(fā)表的論文中,23andMe和 Adaptive Biotechnologies發(fā)表論文最多,前者發(fā)表了 107 篇論文,后者則是 89 篇。兩家公司發(fā)表論文的數(shù)量之和,撐起了所有醫(yī)療領(lǐng)域獨角獸發(fā)文數(shù)量的半壁江山。

雖然發(fā)表了較多論文,但Adaptive不是一家科研機構(gòu),Adaptive Biotechnologies是一家美國西雅圖的測序分析平臺研發(fā)商,該公司希望創(chuàng)建通用血液測試和開發(fā)新的癌癥治療方法,以改善患者病情。

總體來看,Adaptive擁有三大產(chǎn)品線,分別是生命科學研究、臨床診斷、藥物發(fā)現(xiàn),這三大管線中,clonoSEQ已經(jīng)實現(xiàn)商業(yè)化。這三大產(chǎn)品線還獲得包括微軟、羅氏旗下基因泰克、艾伯維等巨頭的認可,達成了長期合作。在今年6月,Adaptive已經(jīng)在納斯達克IPO。

Adaptive的CEO Chad Robin表示:“我們有兩種商業(yè)產(chǎn)品,以及強大的臨床渠道,可以診斷,監(jiān)測和治療癌癥,自身免疫性疾病和傳染病等疾病。我們的目標是開發(fā)和商業(yè)化針對每個患者的免疫驅(qū)動臨床產(chǎn)品!

 

融資歷程.png

Adaptive Biotechnologies融資歷史

成為一家開發(fā)療法的體外診斷公司

Adaptive 成立于2009年,它的目標是開發(fā)和商業(yè)化針對每個患者的免疫驅(qū)動臨床產(chǎn)品。Adaptive擁有專有的T細胞抗原受體(TCR)發(fā)現(xiàn)和免疫分析平臺TruTCR。

Apdptive的官網(wǎng)上寫著這樣一段話:“我們認為,適應(yīng)性免疫系統(tǒng)是自然界中對大多數(shù)疾病進行最精細調(diào)整的診斷和治療方法,但無法對其進行解碼使醫(yī)學界無法充分利用其功能。我們專有的免疫醫(yī)學平臺以前所未有的規(guī)模,精度和速度揭示并翻譯了適應(yīng)性免疫系統(tǒng)的大量遺傳學信息,從而開發(fā)出了生命科學研究,臨床診斷和藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域的產(chǎn)品!

適應(yīng)性免疫應(yīng)答( adaptive immune response)是指體內(nèi)抗原特異性T/B淋巴細胞接受抗原刺激后,自身活化、增殖、分化為效應(yīng)細胞,產(chǎn)生一系列生物學效應(yīng)的全過程。

關(guān)于Adaptive,它的核心定義是體外診斷公司,但它的業(yè)務(wù)已經(jīng)遠遠打破了傳統(tǒng)體外診斷企業(yè)的局限。在診斷方面,Adaptive希望通過基因測序的方式實現(xiàn)早期的癌癥發(fā)現(xiàn),同時,adaptive還希望利用診斷測序平臺開發(fā)更多免疫腫瘤治療方法。如今,adaptive每年與超過125個生物制藥合作伙伴合作。

本質(zhì)上,Adaptive Biotechnologies是將把人體免疫系統(tǒng)本身變成診斷的數(shù)據(jù)源。因為每次免疫系統(tǒng)對疾病做出反應(yīng)時,T細胞受體(TCR)蛋白就會被表達出來以識別抗原。根據(jù)微軟和Adaptive postulate的方法,通過簡單的血檢來繪制TCRs圖譜,對一系列疾病的早期診斷大有幫助。

我們的免疫系統(tǒng)知道的所有信息都被編碼成免疫細胞的基因,如T細胞和B細胞,它們漂浮在我們的血液中。

簡單來說,T細胞是人體里的特種兵,可以實現(xiàn)對病毒的精準打擊。B細胞就像人體里的導彈庫,在病毒入侵身體不久,B細胞和T細胞跟他進行信息的交換后,B細胞就會趕緊分解自己,在短時間內(nèi)復制出大量的B細胞,裝了一肚子導彈的B細胞,那下一步就是發(fā)射了,在一秒鐘內(nèi)一個B細胞大約可以發(fā)射2000發(fā)導彈,發(fā)射的這些導彈,被我們稱為抗體。

Adaptive Biotechnologies公司使用稱為下一代測序的技術(shù)來讀取這些細胞的基因,并創(chuàng)建了一個由數(shù)十億數(shù)據(jù)點組成的免疫譜。

Adaptive Biotechnologies已經(jīng)找到對T細胞和B細胞進行測序的方法。對這些受體進行基因組測序是困難的,因為它們的基因會隨著時間重新排列。但Adaptive已經(jīng)找到了一種方法,利用其強大的ImmunoSEQ平臺,利用計算生物學來對受體進行測序。

產(chǎn)品管線.png

Adaptive戰(zhàn)略與合作伙伴

Adaptive如何實現(xiàn)廣泛用途

那么問題來了,Adaptive的TruTCR和ImmunoSEQ主要用于哪些方面?有哪些成功應(yīng)用的案例呢?

首先是疾病的早期診斷和個體化的治療。

Adaptive已與Microsoft Healthcare NExT計劃合作,以繪制和解碼人類免疫系統(tǒng)。雙方將一起通過免疫測序、專有計算模型和機器學習將TCR序列映射到它們結(jié)合的抗原。利用這些數(shù)據(jù)構(gòu)建一張地圖,將數(shù)百萬個T細胞與數(shù)百萬個專門針對其攻擊的病原體聯(lián)系起來,從而使疾病的診斷更加有效和準確。最終實現(xiàn)為所有疾。◤陌┌Y到自身免疫性疾病再到傳染性疾。┨峁└玫脑\斷的目的。

和微軟合作主要是獲取微軟的云計算及機器學習相關(guān)業(yè)務(wù)。從機學習算法的角度來看,Adaptive Biotechnologies與微軟合作的機器學習算法,不同于IBM Waston的自然語言處理和機器學習,也并非是圖像識別相關(guān)算法。微軟正在和合作伙伴開發(fā)一種應(yīng)用于醫(yī)療保健的獨特方法。

除了用于精準診斷,Adaptive的產(chǎn)品還可以用于細胞療法開發(fā)。

2019年1月,Adaptive與羅氏旗下的Genentech達成合作。Adaptive將使用其研究性TCR發(fā)現(xiàn)平臺來確定患者體內(nèi)最佳的T細胞抗原受體,以便能夠最有效針對每位患者的個性化抗原進行治療。而Genentech則將根據(jù)Adaptive提供的信息設(shè)計和制造個性化的細胞藥物,以便為每位患者提供更好的治療服務(wù)。

憑借在TCR平臺的實力,Adaptive Biotechnologies也是TCR-T療法領(lǐng)域的明星公司。其擁有的TruTCR T細胞受體(TCR)篩查平臺可通過免疫測序和其他技術(shù)來鑒定和表征有效結(jié)合靶抗原的TCR。

TCR-T療法是一種過繼免疫細胞治療(Adoptive Cell Transfer Therapy,ACT)。過繼免疫細胞治療是指從腫瘤患者體內(nèi)分離免疫活性細胞,在體外進行擴增和功能鑒定,然后向患者回輸,從而達到直接殺傷腫瘤或激發(fā)機體的免疫應(yīng)答殺傷腫瘤細胞的目的。

TCR-T療法的基本步驟是:首先鑒定出一種或多種腫瘤抗原作為治療靶點,再獲得特異識別腫瘤抗原的的TCR序列;然后采用基因工程技術(shù),將編碼抗原特異的TCR基因序列導入患者自身T細胞中,從而獲得特異識別腫瘤抗原的TCR-T細胞。這些TCR-T細胞通過體外培養(yǎng)進行大量擴增之后,被回輸?shù)交颊唧w內(nèi)以殺死腫瘤細胞。

管線進展.png

 

Adaptive目前的管線

值得一提的是,Adaptive的野心并不是空談,它已經(jīng)有多個產(chǎn)品獲得FDA批準。FDA通過de novo 審批通道授予clonoSEQ Assay檢測和商業(yè)化許可,clonoSEQ Assay可使用骨髓樣本中的DNA檢測和監(jiān)測多發(fā)性骨髓瘤(MM)和B細胞急性淋巴細胞性白血。ˋLL)患者的最小殘留疾。∕RD)。其旗下ClonoSEQ MRD平臺,對血液中的MRD(微小殘留白血。O敏感,可以檢測到低至1個細胞的水平。

clonoSEQ是第一個也是唯一一個FDA授權(quán)的用于MRD測試的體外診斷測定法。同時也是第一個通過免疫測序技術(shù)獲得FDA批準的臨床診斷工具。

clonoSEQ利用Adaptive的專有免疫測序平臺來鑒定和定量惡性細胞中發(fā)現(xiàn)的特定DNA序列,使臨床醫(yī)生可以在治療期間和治療之后評估和監(jiān)測MRD。該檢測方法可對MRD進行標準化,準確和靈敏的測量,從而使醫(yī)生能夠預測患者的預后,評估隨時間推移對治療的反應(yīng),在緩解期間監(jiān)視患者并檢測潛在的復發(fā)。血液惡性腫瘤的臨床實踐指南認識到,MRD狀態(tài)是臨床結(jié)果和對治療反應(yīng)的可靠指標,并且臨床結(jié)果與診斷為ALL和MM的患者的clonoSEQ Assay測量的MRD水平密切相關(guān)。

Adaptive的clonoSEQ還獲得了藥企AbbVie的青睞,將clonoSEQ用于藥物研發(fā)中,clonoSEQ作為一種準確可靠的方法來評估對新療法對于患者生活水平的改善。在2019年12月雙方達成了一項多年期合作。雙方的合作是以支持AbbVie的藥物venetoclax在多發(fā)性骨髓瘤這一疾病中的臨床試驗。

眾所周知,精準診斷和個性化醫(yī)療是疾病治療的未來趨勢。但繪制一個人的基因圖譜,并考慮他們的表觀遺傳學和他們的生活方式等已經(jīng)足夠復雜,而這對于疾病診斷和治療還遠遠不夠。如果TCRs可以被繪制出來,從而可以更快地診斷。但目前還不清楚的是,映射的TCRs是否真的能夠為更多種類的疾病提供必要的診斷線索。然而,它可能與遺傳學、表觀遺傳學和其他健康數(shù)據(jù)來源一起,補充診斷工作。

兄弟創(chuàng)業(yè),希望打造免疫診斷領(lǐng)域MRI

Adaptive Biotechnologies由Harlan和 Chad Robin兩兄弟共同創(chuàng)立。2009年9月,Robin和他的兄弟創(chuàng)立了這家公司。 Chad負責公司管理,尋找商業(yè)伙伴。ChadRobin擁有賓夕法尼亞大學沃頓商學院的MBA學位和康奈爾大學的管理經(jīng)濟學學士學位。

而哈蘭是首席科學官,他在弗雷德·哈欽森(Fred Hutch)癌癥研究中心擔任計算生物學項目負責人長達13年。(哈蘭曾在Adaptive和Fred Hutch擔任雙重職位,直到Adaptive申請IPO時離開Fred Hutch)。

除了兩兄弟,Adaptive的總裁Julie Rubinstein曾在輝瑞公司(Pfizer Inc.)的腫瘤學部門擔任全球商業(yè)發(fā)展職務(wù),主要致力于癌癥免疫療法。

有趣的是, Chad Robin曾在采訪中表示,公司的成功歸功于他母親,因為母親常常會耐心地傾聽,同時調(diào)停兩人之間的矛盾。

Adaptive的CEO Chad Robins一次采訪中表示:“最終,這將成為‘免疫檢查’或年度體檢的其中一部分,它將對人們的生物系統(tǒng)進行檢查。就像用進行核磁共振或x射線對我們的免疫系統(tǒng)進行檢查一樣普遍。”他認為第一次基于免疫系統(tǒng)的檢測將在未來兩年內(nèi)進行。


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